依法管理宗教事務(wù)，是指政府根據(jù)憲法和有關(guān)法律、法規(guī)及規(guī)范性文件，對(duì)宗教方面涉及國家利益、社會(huì)公共利益的關(guān)系和行為，以及社會(huì)公共活動(dòng)涉及宗教界權(quán)益的關(guān)系和行為的行政管理。依法管理宗教事務(wù)是全面、正確貫徹宗教信仰自由政策的要求和體現(xiàn)，是宗教與社會(huì)主義社會(huì)相適應(yīng)的必然要求，也是我們國家社會(huì)主義民主和法制建設(shè)的重要內(nèi)容。1991年中央制定的6號(hào)文件第一次明確政府依法對(duì)宗教事務(wù)進(jìn)行管理，并就依法管理的內(nèi)容、目標(biāo)和方法提出了具體指導(dǎo)意見。這標(biāo)志著我國宗教工作逐步走上法制化軌道。2001年全國宗教工作會(huì)議，按照實(shí)行依法治國方略的要求，根據(jù)我國宗教工作面臨的形勢和依法管理宗教事務(wù)實(shí)踐的經(jīng)驗(yàn)總結(jié)，對(duì)依法管理宗教事務(wù)的內(nèi)涵作了全面和深刻的闡述。
依法管理宗教事務(wù)，必須依據(jù)憲法和有關(guān)法律、法規(guī)及規(guī)范性政策文件進(jìn)行。宗教必須在法律、法規(guī)和政策范圍內(nèi)活動(dòng)。政府是行政管理的主體，對(duì)宗教事務(wù)的管理是保證正常宗教活動(dòng)的有序進(jìn)行，依法管理宗教事務(wù)的要旨是保護(hù)合法，制止非法，抵御滲透，打擊犯罪。
依法管理宗教事務(wù)，是為了更好地全面貫徹執(zhí)行宗教信仰自由政策，不能片面理解為是限制宗教。依法保護(hù)宗教團(tuán)體和宗教活動(dòng)場所的合法權(quán)益，保護(hù)宗教教職人員履行正常的教務(wù)活動(dòng)，保護(hù)信教群眾正常的宗教活動(dòng)，是依法管理的重點(diǎn)。任何干涉或侵犯正當(dāng)?shù)淖诮绦叛?、正常的宗教活?dòng)和宗教界的合法權(quán)益，都是法律、法規(guī)和政策所不允許的。一旦發(fā)生應(yīng)當(dāng)立即予以糾正，對(duì)觸犯刑律的，要依法處理。同時(shí)，要制止利用宗教進(jìn)行的非法活動(dòng)，抵御境外勢力利用宗教進(jìn)行的滲透，打擊利用宗教進(jìn)行的違法犯罪活動(dòng)。
依法管理宗教事務(wù)，是為了使宗教活動(dòng)納入法律、法規(guī)和政策的范圍，這也符合各宗教的利益和信教群眾的利益，有利于支持和鼓勵(lì)宗教團(tuán)體辦好教務(wù)，加強(qiáng)自主管理。依法管理對(duì)政府來講，不是去包辦或干預(yù)宗教團(tuán)體的內(nèi)部事務(wù)。就宗教團(tuán)體而言，也不能超越國家法律法規(guī)，違反現(xiàn)行政策規(guī)定。